Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ap1s2Q9DB50 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms