Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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