Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D8L0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms