Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms