Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms