Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms