Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl40Q9D783 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms