Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms