Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fundc2Q9D6K8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fundc2Q9D6K8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms