Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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