Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9bQ9D6E4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms