Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms