Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt20Q9D312 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt20Q9D312 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms