Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D1F3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D1F3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms