Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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