Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc7Q9D0M0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms