Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bud23Q9CY21 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms