Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exo5Q9CXP9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms