Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc17Q9CXD9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc17Q9CXD9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms