Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ist1Q9CX00 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms