Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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