Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CWU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CWU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms