Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx10Q9CWT3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms