Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca4Q9CWM2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms