Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd1Q9CRY7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gdpd1Q9CRY7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms