Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQF4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQF4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQF4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms