Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms