Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem216Q9CQC4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem216Q9CQC4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms