Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms