Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms