Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trim12aQ99PQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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