Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms