Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp26Q99MX1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp26Q99MX1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms