Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms