Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms