Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1b1Q99LU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms