Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PsphQ99LS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms