Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf34Q99KR6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms