Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp11Q99K46 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms