Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf11Q99JX1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf11Q99JX1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms