Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms