Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip2Q99JG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms