Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Def8Q99J78 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms