Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt5Q922U2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt5Q922U2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms