Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tubb6Q922F4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms