Protein–RNA interactions for Protein: Q920A0

Optc, Opticin, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptcQ920A0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
OptcQ920A0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OptcQ920A0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms