Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin3bQ91ZU9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin3bQ91ZU9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms