Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc49Q91YK0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms