Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms