Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Synpo2Q91YE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Synpo2Q91YE8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms